El tratamiento tributario del impuesto de timbre nacional genera constantes dudas operativas y jurídicas en la contratación pública y privada dentro del sector salud. Cuando una Empresa Social del Estado (ESE) celebra un contrato o suscribe un documento que alcanza la cuantía gravada, surge la pregunta central: ¿deben las ESE asumir el pago de este tributo o se encuentran jurídicamente amparadas por una exención?
Para dar claridad absoluta a los gestores de salud, asesores jurídicos y contratistas del Estado, la Dirección de Impuestos y Aduanas Nacionales (DIAN) ha ratificado las reglas de sujeción pasiva, analizando la naturaleza de las ESE como entidades de derecho público y delimitando el impacto tributario cuando estas intervienen junto a personas naturales o jurídicas de carácter privado.
Naturaleza Jurídica de las Empresas Sociales del Estado (ESE) y su Marco Tributario
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Cuerpo del Artículo:
En el marco del derecho tributario colombiano, la determinación de qué entidades deben asumir cargas impositivas en sus documentos y contratos es un tema recurrente. En el sector salud, las Empresas Sociales del Estado (ESE) desempeñan un papel fundamental en la garantía de la seguridad social. Sin embargo, al momento de suscribir convenios o expedir actos, surge con frecuencia la duda de si estas entidades descentralizadas deben tributar por concepto del impuesto de timbre nacional.
A través del Radicado Virtual No. 1002025S007181 (Concepto 100208192-810 de 2025), la Dirección de Impuestos y Aduanas Nacionales (DIAN) precisó el alcance de la exención subjetiva que cobija a las ESE y la forma en que los particulares que contratan con ellas deben cumplir sus obligaciones fiscales.
Naturaleza Jurídica de las Empresas Sociales del Estado y su Clasificación Tributaria
Para comprender el tratamiento fiscal de las ESE frente al impuesto de timbre, es necesario analizar su origen y tipificación dentro de la estructura del Estado. El artículo 48 de la Constitución Política establece la seguridad social como un servicio público obligatorio. En concordancia, los artículos 4 y 194 de la Ley 100 de 1993 disponen que la prestación directa de los servicios de salud por parte de la Nación o de las entidades territoriales se realiza a través de las Empresas Sociales del Estado.
La asimilación a establecimientos públicos para efectos fiscales
Las ESE constituyen una categoría especial de entidad pública descentralizada por servicios, dotadas de personería jurídica, patrimonio propio y autonomía administrativa, en los términos de la Ley 489 de 1998.
El artículo 195 de la Ley 100 de 1993 establece de manera expresa que el régimen tributario de las ESE es el mismo aplicable a los establecimientos públicos. Al ser catalogados como organismos encargados de prestar servicios públicos bajo las reglas del Derecho Público, la doctrina de la DIAN concluye que las ESE son consideradas entidades de derecho público en el ámbito fiscal.
Estatuto Tributario – Artículo 533: Define como entidades de derecho público a la Nación, los Departamentos, los Distritos Municipales, los Municipios, los entes universitarios autónomos y las dependencias de las ramas del poder público.
Aplicación de la Exención Subjetiva del Impuesto de Timbre en las ESE
De conformidad con el artículo 532 del Estatuto Tributario (E.T.), las entidades de derecho público gozan de una exención de carácter subjetivo frente al impuesto de timbre nacional. Esto implica que los documentos que estas entidades expidan, otorguen, extiendan o aquellos a cuyo favor se otorguen no generan dicha carga impositiva para la institución pública.
Regra del 50% para la parte no exenta
Una de las inquietudes más habituales en la contratación pública es qué sucede cuando en un mismo documento o contrato concurren una entidad pública exenta (como una ESE) y un tercero o particular no exento.
El inciso segundo del artículo 532 del E.T. resuelve esta situación introduciendo una regla de gravabilidad residual: cuando en una actuación intervienen sujetos exentos y no exentos, el tributo no desaparece por completo. En estos escenarios, la persona o entidad no exenta debe asumir y pagar el 50% (la mitad) del impuesto de timbre regulado en la norma.
- Excepción objetiva: Si la exención no proviene de la condición de las partes (calidad subjetiva), sino de la naturaleza misma del acto o documento (causal objetiva de exención), no se generará el impuesto en ninguna proporción.
- Deber de verificación: Las ESE deben verificar si los contratistas con quienes suscriben acuerdos se encuentran amparados por alguna causal objetiva o subjetiva que los exonere de pagar su porcentaje respectivo.
Ejemplo Práctico:
Una Empresa Social del Estado (ESE) del orden departamental celebra un contrato de suministro de insumos médicos con un proveedor privado por un valor de cuantía gravable.
- Por ser una entidad de derecho público, la ESE no debe pagar el impuesto de timbre en virtud del artículo 532 del E.T.
- Al ser el proveedor privado un sujeto no exento, este deberá calcular y pagar la mitad (50%) del impuesto de timbre aplicable a la cuantía de dicho contrato.
Matriz Resumen: Tratamiento del Impuesto de Timbre con Entidades Públicas
| Condición de los Otorgantes en el Documento | Porcentaje a Pagar por la ESE | Porcentaje a Pagar por el Tercero / Contratista | Fundamento Legal |
| E.S.E. con Entidad de Derecho Público | 0% (Exento) | 0% (Exento) | Art. 532 y 533 E.T. |
| E.S.E. con Persona Natural o Jurídica Privada (No Exenta) | 0% (Exento) | 50% de la tarifa total | Art. 532, Inc. 2 E.T. |
| E.S.E. en un Acto/Documento Exento por Naturaleza Objetiva | 0% (Exento) | 0% (Exento) | Art. 530 y 532 E.T. |
Referencias:
- Fuente Oficial 1: [Estatuto Tributario Colombiano – Artículo 532] – https://normograma.dian.gov.co/dian/
- Fuente Oficial 2: [Ley 100 de 1993 – Sistema de Seguridad Social Integral] – https://www.secretariasenado.gov.co/senado/basedoc/ley_0100_1993.html
- Fuente Oficial 3: [Concepto DIAN 1002025S007181 de mayo de 2025] – https://normograma.dian.gov.co/dian/
Conclusión sobre la Exención de Timbre Nacional en Operaciones de las Empresas Sociales del Estado
El pronunciamiento de la DIAN reafirma la protección fiscal otorgada a la red hospitalaria pública mediante la asimilación del régimen tributario de las ESE al de los establecimientos públicos. Las Empresas Sociales del Estado no deben asumir gravámenes por concepto del impuesto de timbre nacional en la documentación que suscriban o expidan. Sin embargo, la administración de estas instituciones debe velar por la correcta aplicación del tributo frente a sus contratistas privados, garantizando que dichos particulares asuman el 50% de la tarifa correspondiente cuando no gocen de una exención objetiva o subjetiva expresa.